MySQLではレプリケーション機能を使って容易にデータベースを複製することができますが、構築の際にバイナリーログのポジションを間違ったり、スレーブ側の設定が間違っていたりすると、違うデータベースができあがってしまう可能性があります。

simple_mysql_checksum A tool that checksums all tables of a database on two different database hosts, comparing them to verify if they are identical.